Die SBB Cargo haben für ihre Standorte Dillingen, Köln und Freiburg fünf Loks der BR 203.1 bei Alstom Lokomotiven Service (ALS) angemietet, die den SBB-Cargo Anstrich erhielten. Zwei weitere sind in der Region Freiburg im Breisgau eingesetzt. 203 406 bedient seit Ende 2008 den Rheinhafen in Weil am Rhein.

SBB Cargo Deutschland wurde 2002 gegründet und hat ihren Sitz in Duisburg. Das Unternehmen, das zu 100 % SBB Cargo gehört, plant, disponiert und fährt Güterzüge in Deutschland. Destinationen/Abfahrtsorte für Wagengruppen/Ganzzüge in Deutschland sind Duisburg, Köln, Aachen, Rheinhausen, Siegen, Saarbrücken, Ludwigshafen/Mannheim, Karlsruhe, Freiburg im Breisgau, Singen, Lübeck, Bremerhaven/Bremen, Hamburg, Kehl, Vohburg/Neustadt, Dortmund/Bochum, Gelsenkirchen, Ingolstadt, Neuss, Gießen/Mainzlar und Weil am Rhein. Plattformen für den Umschlag Schiene/Straße in Deutschland sind Bremen, Duisburg, Worms sowie Weil am Rhein.